Milí hloubaví přátelé,
analýza funkčních stavů mozku je klíčovou v klinických, ale i teoretických oblastech a její význam roste s přílivem technik přinášejících nové přístupy a výsledky. Česká společnost pro klinickou neurofyziologii se rozhodla vytvořit oficiální platformu sdružující odborníky mapující funkční aktivitu mozku různými metodami (fMRI, PET, SPECT, EEG, NIRS, TMS) v České Republice. Sekce je orientována na otevřené a zapálené specialisty napříč lékařskými, technickými, psychologickými i filozofickými obory pro vytvoření vědomostního a tvůrčího potenciálu, jako základu, na kterém budou vystavěny pilíře pro zvýšení kompetence odborníků a pracovišť, nalézání partnerů pro řešení aktuálních problémů, koordinaci úsilí a hledání klinických aplikací.

Zapojte se do tohoto projektu nejprve registrací na webu hubram.cz. Pro plnohodnotné členství se všemi výhodami a právy je dále nutné stát se členem ČSKN ČLS JEP - stačí vyplnit jednoduchý online registrační formulář. Neváhejte a staňte se členy ještě dnes !

Antispamové opatření

Vzhledem k neutuchajícímu zájmu čínských spammerů o náš server mne už přestalo bavit ruční promazávání účtů a rozhodl jsem se zakročit. Odříznout ČLR od přístupu k HuBraMu nechci a tudíž byla na výběr nějaká CAPCHA. Rozhodl jsem se pro jednoduchý Turingův stroj, který zájemce o registraci "zkouší" ze základních zkratek, které potenciální zájemce o klinickou neurofyziologii buď běžně znají a používají, nebo budou schopni vyhledat. Pokud budou roboti moc chytří, budeme muset zavést obrázkovou Capcha, která ukáže fMRI aktivaci a uživatel bude muset popsat její anatomickou lokalizaci ;-) Hezké léto přeje

Jirka Keller

Vzdělávací fMRI workshop v Brně

Vážení hubramáci,

dovoluji si vás pozvat na vzdělávací workshop, který budeme realizova 25.4.2012 v Brně (posluchárna neurologické kliniky, budova C, FN u sv. Anny, Pekařská 53, Brno). Začátek workshopu bude v 9:00 a předpokládaný konec mezi 13:00 a 14:00. Uprostřed bude přestávka se zajištěním (snad) nějakého občerstvení.
Obsah workshopu by měl pokrát následující témata: Princip fMRI, základní i pokročilá analýza fMRI dat (GLM/SPM, ICA), konektivita, artefakty a šum ve fMRI, modelování HRF, základy EEG-fMRI a související. V nejbližších dnech zde a na http://fmri.mchmi.com zveřejníme podrobnější program. Workshop bude směřován především pro PHD studenty, začínající výzkumníky v oblasti fMRI a další osoby, které se o fMRI (a zejména analýze fMRI dat) chtějí něco více dovědět a nyní mají jen základní povědomí.
Účast na akci je zdarma, ale prosíme o registraci z důvodu kapacity. Registrujte se emailem (michal.mikl@ceitec.muni.cz) s uvedením svého jména a instituce.

Trička HuBraM

Trička HubramMilá kolegyně, milý kolego,

v souvislosti se založením HuBraM sekce ČSKN ČLS JEP na fMRI workshopu v Olomouci se chystáme pro zájemce zprostředkovat nákup trička s logem
HuBraM, tak jak jsou zobrazena na hrudích pionýrů naší sekce. Aktuálně je možno si objednat tričko s následujícími příznaky:

  • odlišného střihu pro mužskou a ženskou postavu:  M/F;
  • velikosti: S/M/L/XL/XXL/XXXL/XXXXL;
  • barva černá (doporučená) nebo bílá: B/W;
  • tiskem loga vpředu nebo vpředu i na zádech:  SS/DS;
  • kvality materiálu biobavlna vs. obyč.: 1/2.

Sdílená data

Možná máte výborný nápad jak lépe zpracovat data, která ukazují na falešné korelace v „resting state“ funkční konektivitě (Jonathan D. Power, et al. Spurious but systematic correlations in functional
connectivity MRI networks arise from subject motion, NeuroImage, Volume 59, Issue 3, 1 February 2012, Pages 2142-2154
)?

Nevěšte hlavu, autoři data uvolnili a můžete je nalézt zde společně s dalšími, víc než tisíci, záznamy v projektu ‘1000 Functional Connectomes’ http://fcon_1000.projects.nitrc.org/.

Pokud nabízíte kvalitní data, přidejte se.

Vzdělávací workshop v rámci akce "10 let fMRI v Brně"

Vážení HuBraMáci,v návaznosti na příspěvek ke škole klinické neurofyziologie a snahu o zpřístupnění vzdělávacích materiálů si dovolím zmínit akci, která proběhla v Brně v prosinci 2010. Jelikož fMRI výzkum v Brně slavil v roce 2010 již desetileté výročí, uspořádali jsme seminář, na němž byly představeny průřezově témata, kterými se nerozobrazovací brněnský tým zabýval, následovaný vzdělávacím workshopem, na němž jsme se snažili vysvětlit principy funkční magnetické rezonance, základní i některé pokročilé přístupy v analýze fMRI dat a témata z analýzy konektivity. Prezetnace ze vzdělávací části jsou nyní pro členy HuBraMu přístupné pod správcem souborů v adresáři users/10 let fMRI v Brně a přímé odkazy jsou umístěné i v tomto článku.

Škola klinické neurofyziologie 2011

Vážení HuBraMáci,

Návod pro práci se soubory (Správce souborů)

Stručné představení správce souborů

V levém navigačním menu naleznete položku správce souborů, která vede do složky http://hubram.cz/files (můžete používat přímý odkaz tam), kde je k dispozici adresářová struktura share/users a dále (použit systém webfm). Nové soubory se do aktuální složky (jejíž obsah je zobrazen v pravé části okna) nahrávají pomocí File Upload. Jedinou atypickou věcí je zde kontextové menu vyvolané PRAVÝM myšítkem, to jest ležícím na opačné straně myši než by jeden při prohlížení internetu čekal. Při kliknutí v levém adresářovém stromu můžete přidat adresář nebo vyhledávat, vpravo je možností více - adresáře lze mazat, přejmenovat. U souborů je možností ještě více - prohlížení metadat (například rozlišení obrázků), stažení souboru, a nastavení přístupovým práv (viz níže).

Prvních 17 dní od spuštění portálu

Před 17 dny byl do ostrého provozu spuštěn tento portál. Čeho bylo zatím dosaženo:

  • všech 13 členů přípravného výboru má funkční účet
  • další 4 zájemci se zaregistrovali na stránkách
  • google nás vzal na vědomí a konečně jsme přeskočili dvě méně relevantní stránky (ČSKN a jakýsi comming soon hubram tečka com, takže vypadáváme na prvním místě po zadání termínu "hubram")
  • naše stránky se zobrazují  ve vyhledávači seznam.cz
  • je plně funkční přihlašování přes openID (momentálně využívají 4 uživatelé)
  • doladěn osobní formulář, vytvořeny základní kategorie ("štítky")

Na co se můžete těšit:

  • integrace s kalendářem na Facebooku (29.12.2011 funkční beta verze )
  • systém nahrávání souborů (31.12.2011 - soubory jsou k dispozici všem registrovaným uživatelům, funguje nahrávání i stahování)
  • fotky HuBraM triček - registrovaným jsou k dispozici od 8.1.2012 v sekci Správce souborů  share/users/Trička
  • nějaké návody/manuály k těmto stránkám (po správci souborů asi také představení dalších pokročilých funkcí)

Aktuální info o dění v sekci – prosinec 2011

Vážení přátelé,

po roce pozvolných příprav a iniciačních diskusí týkajících se vzniku sekce pro funkční mapování mozku se stav věci výrazněji posunul a nyní směřujeme k vlastnímu vzniku sekce. Tento akt by měl snad proběhnout na jaře 2012 v návaznosti na olomoucký fMRI workshop.

Syndikovat obsah