Milí hloubaví přátelé,
analýza funkčních stavů mozku je klíčovou v klinických, ale i teoretických oblastech a její význam roste s přílivem technik přinášejících nové přístupy a výsledky. Česká společnost pro klinickou neurofyziologii se rozhodla vytvořit oficiální platformu sdružující odborníky mapující funkční aktivitu mozku různými metodami (fMRI, PET, SPECT, EEG, NIRS, TMS) v České Republice. Sekce je orientována na otevřené a zapálené specialisty napříč lékařskými, technickými, psychologickými i filozofickými obory pro vytvoření vědomostního a tvůrčího potenciálu, jako základu, na kterém budou vystavěny pilíře pro zvýšení kompetence odborníků a pracovišť, nalézání partnerů pro řešení aktuálních problémů, koordinaci úsilí a hledání klinických aplikací.

Zapojte se do tohoto projektu nejprve registrací na webu hubram.cz. Pro plnohodnotné členství se všemi výhodami a právy je dále nutné stát se členem ČSKN ČLS JEP - stačí vyplnit jednoduchý online registrační formulář. Neváhejte a staňte se členy ještě dnes !

Vzdělávací workshop + den otevřených dveří CF MAFIL a setkání s uživateli

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na vzdělávcí workshop zaměřený na neurozobrazování (fMRI, morfometrie, DTI) a elektrofyziologii (EEG, simultánní elektrofyziologie v MR). Workshop bude dvoudenní (11.11. - 12.11.2015) a letos bude poprvé připoraven v angličtině. Novinkou je také zavedení symbolického registračního poplatku - zvýhodněni jsou studenti a členové naší sekce HuBraM. Program workshopu naleznete v samostatném souboru.

Workshop bude doplněn 13.11. dopoledne dnem otevřených dveří a setkáním s uživateli. Současní i budoucí uživatelé a další zájemci jsou zváni k přátelské diskusi nad přístupovými pravidly, fungováním CF MAFIL a možnostmi popskytovaných služeb.

Za CF MAFIL srdečně zve
Michal Mikl

Vzdělávací fmri workshop v Brně - pokročilé fMRI

Vážení Hubramáci,

přijměte pozvání na vzdělávací workshop s tématem pokročilého fMRI, který se bude konat v Brně 9.4.2015 a bude přímo předcházet 11. olomouckému fMRI workshopu. Bližší informace jsou uvedeny v přiložené PDF pozvánce. Tématicky je program zaměřen na potlačení pohybových a fyziologických artefaktů, využití záznamu fyziologických dějů ve fMRI, různé problémy při zpracování fMRI dat (zejména analýze konektivity) a možnosti jejich řešení atd.

S pozdravem
Michal Mikl

Open data



Mohlo by leckoho zaujmout, že i jinak otevřený nakladatel Frontiers
oznamuje možnost publikovat data v časopisech s IF :)

Data Reports, a new type of peer-reviewed article http://shar.es/1WboXZ
 

11. fMRI workshop v Olomouci

9. - 10. 4. 2015 se koná olomoucký fMRI workshop,
pořádaný ve spolupráci s naší Sekcí pro funkční mapování mozku. 

Uzávěrka přihlášek je 15. 3. 2015.

Pozvaným řečníkem bude Prof. Giovanni
Buccino z Univ. Parma a Uni.
Catanzaro, známý studiemi pozorování akce / zrcadlových neuronů. Prof.
Buccino má h-index 30.



Petr Hluštík

Vzdělávací fmri workshop

Vážení hubramáci,

dovoluji si Vás pozvat na pravidelný vzdělávací fMRI workshop pořádaný vždy na podzim v Brně, tenktokráte v termínu 14.11.2014. Workshop proběhne v budově A35 (oválná budova CEITEC, vstup z ulice Studentská) univerzitního kampusu Bohunice od 9:00 - zasedací místnost 145. Odpolední praktická část bude realizována v počítačové učebně IBA, budova A1, 6. patro. Bližsí informace jsou na pozvánce v příloze.


Za organizátory

Michal Mikl

Nabídka EEG měření

Vážení hubramáci,

Masarykova univerzita, CEITEC MU, laboratoř multimodálního a funkčního zobrazování (MAFIL) nabízí pro externí zájemce realizaci projektů v nově vybudované elektrofyziologické laboratoři s 256 kanálovým EEG systémem. Další informace jsou v přiloženém souboru.

Do 31.10. je možné podávat žádosti k měření v rámci Open Access projektu, kdy získá výzkumník měřící čas včetně technické spolupráce na měření zdarma. Bližší informace k využití Open Access jsou na http://www.ceitec.cz/projekt-ceitec-open-access/t1368

Případné dotazy stran technického zajištění a možností může zodpovědět Ing. Pavel Daniel (pavel.daniel@ceitec.muni.cz ) nebo Ing. Martin Kojan (martin.kojan@ceitec.muni.cz) .



S pozdravem

Michal Mikl


10. letní škola matematické biologie

Vážení kolegové a příznivci data-analytických krás,

Dovolujeme si Vás pozvat na letošní letní školu matematické biologie, která se uskuteční od 9. do 12. září 2014 v nově zrekonstruovaném Kaprálově mlýně v lůně přírody nedaleko Ochoze u Brna. Letošní jubilejní 10. ročník letní školy bude věnován následujícímu ústřednímu tématu: "Analýza a zpracování obrazových dat v neurovědách --- Image Data Analysis and Processing in Neuroscience". Vedle lektorů z řad vyučujících IBA MU pro vás zajistí zajímavé přednášky a cvičení také odborníci z Fakultní nemocnice Brno, ze Středoevropského technologického institutu CEITEC, z pražské techniky ČVUT a dále také ze zahraničí: prof. Giovanni Montana z Velké Británie a Dr. René Mandl z Holandska.

Virtuální MR skener - kdo si hraje, nezlobí !

V repozitářích neurodebianu jsem náhodou nalezl balíček virtual-mri-nonfree. Tento balíček je k dispozici i pro Ubuntu. Pokud tedy používáte operační systém GNU/Linux vycházející z Debianu (Debian, NeuroDebian, Ubuntu, Mint atd), stačí napsat apt-get install virtual-mri-nonfree a spustit program virtual-mri. Uživatelé Windows a Mac OS X mohou program stáhnout na stránkách projektu - je v Javě a tudíž by s instalací neměl být problém. Aplikace je z roku 2006, ale stále pěkná !
Pokud kliknete na druhou ikonku vpravo nahoře, místo fantomu budete měřit mozek (měří se příkazem start). Existují nástroje pro program imagej, kterými můžete předpřipravit vlastní data - to se mi ale zatím nepodařilo rozchodit - pokud se vám podaří, podělte se v diskuzi ! Přeji dobrou zábavu !

screenshot

Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku

Vážení hubramáci,

přijměte pozvání na Vzdělávací workshop – morfometrické metody a jejich přesah k funkčnímu zobrazování mozku, který se uskuteční  27. března 2014 od 9:00 h v Univerzitním kampusu MU, budova INBIT, velká zasedací místnost, Kamenice 34, Brno.

Workshop bude zaměřen na magisterské i doktorské studenty a začínající výzkumníky v oblasti neurozobrazování a funkčního mapování mozku bez ohledu na primární oblast vzdělání. Předpokládá se však určitá základní znalost/představa o problematice funkčního mapování mozku či obecně zobrazování pomocí MR tomografu. Velká část workshopu bude věnována morfometrickým metodám (voxel based morfometrie apod.) a dále přesahům a návaznostem mezi morfometrickými přístupy (resp. informace získanými z analýzy strukturních snímků) a funkčním mapováním mozku.

Tematicky bude workshop pokrývat tyto oblasti:
•    Základní principy morfometrických metod
•    Předzpracování strukturních (anatomických) snímků pomocí software SPM
•    Voxel-based morphometry (VBM), Source-based morphometry (SBM), Deformation-based morphometry (DBM)

Jak se jednoduše zaregistrovat na HuBraMu aniž byste museli vymýšlet nové heslo

Úvod

Stránka HuBraM.cz podporuje přihlášení pomocí OpenId. V praxi to znamená, že nemusíte pracně vymýšlet nové neprůstřelné heslo, ale že je možné ověřovat identitu pomocí třetí strany. Tou je typicky Váš poskytovatel e-mailu. Jak to v praxi funguje ?

Kliknete na odkaz "přihlásit pomoci OpenID" (vlevo pod přihlašovacím okénkem). Systém se vás zeptá na OpenID. Následuje přepojení na poskytovatele Vašeho emailu, který se zeptá na vaše heslo (to ale na náš server nepošle) a zda se opravdu chcete přihlásit na
HuBraM. Pokud máte v jiném okně otevřené webové rozhraní mailu, ani na to heslo se nezeptá. V dalším kroku jenom odpoví HuBraMu, že jste to vy.

Jak se jednoduše zaregistrovat

  1. Dejme tomu, že máte e-mail jan.novak@seznam.cz (stejně to funguje pro email.cz, post.cz, spoluzaci.cz, stream.cz, firmy.cz). Vaše OpenID je potom jan.novak.id.seznam.cz (viz
Syndikovat obsah